Năm 2014, Chi cục Thuế thành phố Yên Bái đã hoàn thành 70 cuộc kiểm tra tại trụ sở NNT theo đúng quy trình nghiệp vụ, đúng pháp luật, sau kiểm tra đã ban hành quyết định xử lý về thuế, truy thu và xử phạt vi phạm hành chính 1,9 tỷ đồng, giảm khấu trừ 434 triệu đồng, giảm lỗ 1,2 tỷ đồng.

Năm 2014, Chi cục Thuế thành phố Yên Bái đã hoàn thành 70 cuộc kiểm tra tại trụ sở NNT theo đúng quy trình nghiệp vụ, đúng pháp luật, sau kiểm tra đã ban hành quyết định xử lý về thuế, truy thu và xử phạt vi phạm hành chính 1,9 tỷ đồng, giảm khấu trừ 434 triệu đồng, giảm lỗ 1,2 tỷ đồng. Thành phố Yên Bái hiện có 634 doanh nghiệp, hợp tác xã, trong đó, doanh nghiệp quốc doanh 27 đơn vị, doanh nghiệp ngoài quốc doanh 581 đơn vị và đơn vị sự nghiệp có thu 26 đơn vị. Tuy số doanh nghiệp lớn nhưng đa số ở quy mô nhỏ và siêu nhỏ, bộ máy quản lý không đầy đủ, cán bộ làm công tác kế toán không ổn định, thường xuyên thay đổi và kiêm nhiệm nhiều việc. Do đó, việc hạch toán, kế toán, kê khai tính thuế còn nhiều sai sót, việc lập và lưu trữ sổ sách, chứng từ kế toán chưa khoa học gây không ít khó khăn cho công tác kiểm tra. Ông Phạm Thanh Hải - Chi cục trưởng Chi cục Thuế thành phố Yên Bái cho biết: "Xác định nguồn thu từ các doanh nghiệp có tính chất ổn định và chiếm tỷ trọng cao trong tổng thu ngân sách trên địa bàn, Chi cục đã đặc biệt quan tâm đến công tác quản lý thuế đối với doanh nghiệp, đặc biệt là công tác kiểm tra thuế. Ngay từ đầu năm, Chi cục đã bố trí cán bộ có đủ năng lực chuyên môn, phân công quản lý doanh nghiệp, lập kế hoạch kiểm tra trên cơ sở phân tích các thông tin về kê khai thuế của người nộp thuế (NNT) và các thông tin khác trong quá trình quản lý thuế để lựa chọn doanh nghiệp có dấu hiệu không rõ ràng về thuế, đưa vào kế hoạch kiểm tra. Trước khi ban hành quyết định kiểm tra, các đoàn kiểm tra đã cùng phân tích sâu hồ sơ khai thuế của NNT, đối chiếu với thông tin, dữ liệu quản lý thuế của cơ quan thuế có được. Do có sự chuẩn bị kỹ lưỡng nên hiệu quả công tác kiểm tra đạt hiệu quả, giảm thời gian, tránh phiền hà cho NNT”.  Căn cứ vào đặc điểm của doanh nghiệp, việc kiểm tra thuế đã tập trung vào việc thực hiện thanh toán qua ngân hàng của NNT, qua đó, xác minh số thuế được khấu trừ, hoàn thuế, việc kê khai doanh thu, giá bán hàng hóa dịch vụ. Kiểm tra đúng chi phí được khấu trừ tính thuế thu nhập doanh nghiệp, việc xác định giá trị, nguồn gốc, quyền sở hữu tài sản cố định để trích và tính chi phí khấu hao; xác định chi phí tiền vay đối chiếu với tình hình góp vốn điều lệ của doanh nghiệp để loại khỏi chi phí phần lãi vay tương ứng với phần vốn điều lệ chưa góp đủ; kiểm tra các khoản mục chi phí không phục vụ cho sản xuất kinh doanh của doanh nghiệp như: tiền lương của giám đốc công ty TNHH một thành viên do cá nhân làm chủ sở hữu; chi phí khấu hao nhà, điện, nước của nhà ở tư nhân; các khoản chi phí không có hóa đơn chứng từ hợp lệ. Ngoài ra, Chi cục còn kiểm tra các khoản thu nhập khác như: thu nhập từ bán, cho thuê tài sản, các khoản tiền lương, các khoản chiết khấu được hưởng; tăng cường việc đối chiếu, xác minh để hạn chế việc sử dụng hóa đơn bất hợp pháp. Năm 2014, Chi cục đã hoàn thành 70 cuộc kiểm tra tại trụ sở NNT theo đúng quy trình nghiệp vụ, đúng pháp luật, sau kiểm tra đã ban hành quyết định xử lý về thuế, truy thu và xử phạt vi phạm hành chính 1,9 tỷ đồng, giảm khấu trừ 434 triệu đồng, giảm lỗ 1,2 tỷ đồng. Ngoài ra, các đoàn kiểm tra còn tuyên truyền chính sách, pháp luật thuế, hướng dẫn NNT hạch toán kế toán, kê khai nộp thuế đúng quy định, tạo sự đồng thuận giữa NNT và cơ quan thuế. Ngoài ra, việc kiểm tra hồ sơ khai thuế tại trụ sở cơ quan thuế cũng được Chi cục đặc biệt quan tâm. Chi cục đã giao cho Đội Kiểm tra phân công cán bộ quản lý doanh nghiệp, thường xuyên kiểm tra 100% hồ sơ khai thuế, ứng dụng công nghệ thông tin trong kiểm tra; trong năm qua, đã kiểm tra, phân tích 1.409 hồ sơ khai thuế, quyết toán thuế tại cơ quan thuế, yêu cầu NNT hoàn thiện, bổ sung hồ sơ khai thuế, điều chỉnh tăng số thuế phải nộp, giảm số thuế được khấu trừ trên 100 triệu đồng.    Nhiệm vụ kiểm tra thuế trong doanh nghiệp năm 2015 còn rất nặng nề, đòi hỏi Chi cục cần xây dựng phương án, biện pháp thực hiện nhiệm vụ tới từng cán bộ và bộ phận thực hiện một cách khoa học; có phương án đánh giá, phân tích rủi ro đối với từng doanh nghiệp để giúp cho công tác thanh tra, kiểm tra đạt hiệu quả cao; đồng thời, tăng cường hơn nữa công tác kiểm tra hồ sơ khai thuế tại trụ sở cơ quan thuế, tăng cường kiểm tra tại trụ sở NNT để phát hiện và chấn chỉnh kịp thời các sai phạm trong quản lý; tăng cường kiểm tra, khai thác các nguồn thu từ xây dựng, bán hàng vãng lai ngoại tỉnh để tăng thu, bù đắp các nguồn thu thiếu hụt.