Năm 2016, thiên tai, đặc biệt là mưa lũ trên địa bàn huyện Văn Yên đã làm 4 nhà bị sập hoàn toàn, 32 nhà bị hư hỏng nặng. Mưa lũ gây thiệt hại trên 434 ha hoa màu, cuốn trôi làm chết 75 con gia súc, 288 con gia cầm, làm hư hỏng, sạt lở nhiều ao, hồ, đầm, nhiều tuyến đường trọng yếu, ước tính thiệt hại trên 15 tỷ đồng.